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LABORATORIO DE INTERACCIÓN AMBIENTE MICROORGANISMO

Historia

El laboratorio fue fundado en 1999 por el Dr. Alberto Mendoza (1957-2017) uno de los miembros fundadores del Centro de Biotecnología Genómica. Inicialmente el laboratorio de denominó Biotecnología Vegetal I y en 2007 se adecuó el nombre del laboratorio a Laboratorio Interacción Planta-Microorganismo enfocando su actividad al estudio de microorganismos promotores del crecimiento vegetal, abordando el estudio de aplicaciones biotecnológicas de microorganismos ambientales como la biorremediación y complementando los estudios con herramientas genómicas. En marzo de 2018 al incluir otra línea de investigación, enfocada a la detección de patógenos en diversos nichos ambientales se adecua su nombre a Interacción Ambiente Microorganismo.

Objetivo

Aplicación de herramientas epidemiológicas, microbiológicas y moleculares para estudiar las interacciones entre los microorganismos y sus nichos, y su relación con la salud humana y equilibrio ecológico.

Líneas de Investigación

1. Biodiversidad y análisis de poblaciones microbianas implicadas en interacciones con vegetales

a. Biología funcional de Azospirillum sp.

b. Caracterización de poblaciones microbianas asociadas a rizósfera

c. Caracterización funcional de poblaciones microbianas en suelos

d. Efecto de cultivos transgénicos sobre actividad microbiana a partir del medio ambiente

2. Caracterización de microorganismos con potencial metabolismo de xenobióticos

a. Biología funcional de Sphingobium yanoikuyae

b. Biología funcional de Microbacterium sp.

c. Aislamiento y caracterización de microorganismos nativos con potencial aplicación biotecnológica en degradación de xenobióticos

d. Estudio de efecto de consorcios de microorganismos con actividad degradativa de xenobióticos

3. Ecología y epidemiologia de microorganismos con capacidad patogénica.

a. Inocuidad microbiológica de alimentos

b. Inocuidad microbiológica ambiental

c. Epidemiología molecular de microorganismos patógenos distribuidos en el medio ambiente (Tuberculosis,Cryptococos, Amibas vida libre, infecciones asociadas a pie diabético)

d. Actividad antimicrobiana de productos naturales

e. Polimorfismos relacionados a resistencia o susceptibilidad a infecciones

4. Genómica microbiana funcional

a. Diversidad genética de microorganismos con capacidad patogénica. 

b. Epidemiología molecular de elementos genéticos móviles en microorganismos de nichos ambientales.

c. Genómica funcional de microorganismos con potencial biotecnológico.

Tesistas

Maestría

"Análisis e identificación de genes relacionados con el estrés bacteriano en Azospirillum brasilense CBG 497"

"Caracterización de una cepa de Microbacterium petrolarium aislada de suelos contaminados con hidrocarburos en la cuenca de Burgos"

“Detección molecular de amibas de vida libre en aguas superficiales de la ciudad de Reynosa, Tamaulipas”

“Detección molecular directa de bacterias Gram-positivas y anaerobias de alto riesgo de infecciones en pie diabético”

“Detección de especies del género Mycobacterium en aguas superficiales del Noreste de Tamaulipas”

Doctorado

"Efecto en la diversidad bacteriana asociada a la rizosfera de un algodón transgénico respecto a uno convencional"

"Análisis fisiológico y genómico de una bacteria con capacidad de degradar hidrocarburos: Sphingobium yanoikuyae"

“Detección, prevalencia y análisis molecular de la diversidad bacteriana con potencial de riesgo sanitario en aguas superficiales del rio bravo en Tamaulipas”

“Análisis del resistoma y mobiloma en cepas de E. coli resistentes a tetraciclinas aisladas en el Noreste de Tamaulipas”

“Caracterización del perfil inmuno-microbiológico de infecciones en heridas de pie diabético”

“Caracterización molecular y de resistencia a antimicrobianos de Escherichia coli y Enterococcus spp. aisladas en el proceso de sacrificio de bovinos en un rastro TIF”

Publicaciones (2012-2017)

2018

2017

2016

2015

2014

2012

PATENTES

Cepas bacterianas con actividad bio-estimulante para plantas. MX/a/2017/015637

TRANSFERENCIA DE TECNOLOGÍA

Producción de Bioestimulante basado en la bacteria Azospirillum brasilense a la empresa Open Heavens. S. de R.L. de CV. Febrero de 2010. Producto biológico para la estimulación del crecimiento en gramíneas a base de Azospirillum brasilense. BioGea S.A., de CV. 2014

Directorio del laboratorio

Nombre
Extensión

Dr. Virgilio Bocanegra García

Profesor Titular

vbocanegra@ipn.mx

87755

M. en C. María Antonia Cruz Hernández

Profesor Asociado

macruzh@ipn.mx

87717

Ing. Amb. Silvia Susana Fernández Dávila

Técnico Investigador

sfernandezd@ipn.mx

87741

M.en D. Eyra Liliana Ortiz Pérez

Técnico Investigador

eortizp@ipn.mx

87741