LABORATORIO DE BIOINFORMÁTICA

Objetivos

Analizar la diversidad genética de especies no modelo y la dinámica de sus poblaciones, con el apoyo de la biología computacional y bioinformática se establecen los factores de evolución de las especies y su adaptación.

Líneas de Investigación

Diversidad genética y genómica comparativa

En esta línea de investigación se analiza y compara la estructura de genomas nucleares y mitocondriales usando la genética poblacional, genética de la conservación y filogenia.

Tesistas

Maestría

  • Diversidad genética y estructura poblacional del atún aleta negra (Thunnus atlanticus).

Jesse Ríos. 2020 Estudiante de Maestría en Ciencias de la Vida. Universidad Autónoma de Tamaulipas

  • Análisis de diversidad genética de poblaciones de Coyotes (Canis latrans) en diferentes zoológicos de la República Mexicana.

Julio Sendejas. 2020 Maestría en Ciencias Biológicas Universidad Autónoma de San Nicolás de Hidalgo

Publicaciones (2012-2017)

2018

Jessica Beatriz Herrera-Ojeda et al., 2018. Épocas de nacimiento basadas en un índice climático para el ajuste de modelos estadísticos para peso vivo de ganado bovino en México. Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias 2018 ISSN: 2007-1124 JCR. DOI: 10.22319/rmcp.v9i4.4517

Zepeda-Batista J.L. et al., 2018. Screening genetic diseases prevalence in Braunvieh cattle. Tropical animal health and production, pp.1-7. ISSN: 1573-7438 JCR. DOI: 10.1007/s11250-018-1655-y

Parra-Bracamonte G.M. et al., 2018. Assessment of some non-genetic factors that affects egg mass weight of Channel catfish. Latin American Journal of Aquatic Research 45(5): 979-982. ISSN 0718-560X. JCR. DOI: 10.3856/vol45-issue5-fulltext-13

2017

Catota-Gómez et al., 2017. Frequency and association of polymorphisms in CSN3 gene with milk yield and composition in Saanen goats Ecosist. Recur. Agropec. 4(12):411-417. DOI: 10.19136/era.a4n12.1165

Garza Brenner et al., 2017. Association of SNPs in dopamine and serotonin pathway genes and their interacting genes with temperament traits in Charolais cows. J Appl Genetics 58:363–371. DOI: 10.1007/s13353-016-0383-0

José Fernando Vázquez-Armijo, et al., 2017. Diversity and effective population size of four horse breeds from microsatellite DNA markers in South-Central Mexico. Arch. Anim. Breed., 60, 137–143. DOI: 10.5194/aab-60-137-2017

2016

Sifuentes Rincón et al., 2016. Bovine dopamine receptors DRD1, DRD4, and DRD5: genetic polymorphisms and diversities among ten cattle breeds. Genetics and Molecular Research 15 (1): gmr.15017725. DOI: 10.4238/gmr.15017725.

Pascuala Ambriz-Morales et al., 2016. The complete mitochondrial genomes of nine white-tailed deer subspecies and their genomic differences. Journal of Mammalogy, 97 (1): 234–245. DOI: 10.1093/jmammal/gyv172

Jahuey-Martínez F.J. 2016. Genome-wide association analysis of growth traits in Charolais beef cattle. Journal of Animal Science. 94:4570–4582. doi:10.2527/jas2016-0359 Print ISSN: 0021-8812; Online ISSN: 1525-3163 JCR.

Hurtado, L.A., et al., 2016. Thousands of SNPs in the critically endangered Kemp’s Ridley sea turtle (Lepidochelys kempii) revealed by ddRAD-seq: opportunities for previously elusive conservation genetics research. Gulf of Mexico Science 33(2):214-218. DOI: 10.18785/goms.3302.08

Cuevas-Rodríguez et al., 2016. Novel single nucleotide polymorphisms in candidate genes for growth in tilapia (Oreochromis niloticus) R. Bras. Zootec., 45(6):345-348, 2016. DOI: 10.1590/S1806-92902016000600009

Parra-Bracamnote et al., 2016. Genetic trends for live weight traits reflect breeding strategies in registered Charolais farms in Mexico. Tropical Animal Health and Production 48(7): 1729-1738. DOI: 10.1007/s11250-016-1150-2 ISSN: 1573-7438 JCR.

2015

Pacheco Contreras et al., 2015. Milk composition and its relationship with weaning weight in Charolais cattle R. Bras. Zootec., 44(6):207-212. DOI: 10.1590/S1806-92902015000600002

Paredes-Sánchez et al., 2015. Associations of SNPs located at candidate genes to bovine growth traits, prioritized with an interaction networks construction approach. BMC Genetics 2015 16:91. DOI: 10.1186/s12863-015-0247-3

2014

De La Rosa-Reyna, X. F., et al., 2014. Identification of two channel catfish stocks, Ictalurus punctatus, cultivated in Northeast Mexico. Journal of the World Aquaculture Society 45:104-114. DOI: 10.1111/jwas.12109

2012

De la Rosa-Reyna, X. F., et al., 2012. Genetic diversity and structure among subspecies of white-tailed deer in Mexico. Journal of Mammalogy 93:1158-1168. DOI: 10.1644/11-MAMM-A-212.2

PATENTES

• Otorgamiento de Título de Modelo de Utilidad. 3857. Dispositivo manual para extraer muestras cilíndricas de cortes de carne cruda o cocida o productos de textura similar. 17/05/2018. MX/2018/43763​

• Registro de patente. Sistema de control para el monitoreo preventivo de rumiantes en manejo predestete intensivo. Solicitud: MX/a/2014/015324. Fecha de registro: 15/12/2014.

Transferencia de tecnología

• Servicio de diagnóstico molecular aplicado a la ganadería bovina.​

Directorio del laboratorio

Nombre
Extensión

cDr. Xóchitl Fabiola de la Rosa Reyna

Profesor Titular

xdelarosa@ipn.mx

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