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​​INTERACCIÓN AMBIENTE ​MICROORGANISMO 

El laboratorio fue fundado en 1999 por el Dr. Alberto Mendoza Herrera, quien fue también uno de los miembros fundadores del Centro de Biotecnología Genómica. Al grupo de investigación se incorporó posteriormente la M. C. María Antonia Cruz Hernández, en el año 2000. Inicialmente el laboratorio de denominó Biotecnología Vegetal I, y las líneas de investigación estaban enfocadas al aislamiento, estudio y caracterización de los genomas de Azospirillum brasilense, y Frankia sp. a partir de una colección de cepas aisladas en zonas áridas dado que estas cepas son de particular interés para cultivos. A partir del 2003 se incluyeron estudios de detección de organismos genéticamente modificados, así como también el estudio del efecto sobre las poblaciones microbianas nativas de plantas transgénicas. Debido a esto, en 2007 se adecuó el nombre del laboratorio a “Laboratorio Interacción Planta-Microorganismo” para que reflejara apropiadamente las actividades de investigación de este. Durante el 2004, se incorporó la Ing. Silvia Susana Fernández Dávila y posteriormente la en 2014 la M. en D. Eyra Liliana Ortiz Pérez. A partir del 2012 y como parte de las observaciones de las propiedades de microorganismos aislados a partir de estudios de microbiología agrícola, se determinó que dichos microorganismos pueden tener potencial biotecnológico adicional. Por lo cual se incluyeron estudios de biodegradación de contaminantes en microorganismos con posible actividad de degradación de xenobióticos, incorporándose dichos estudios a una segunda línea de investigación en el laboratorio, utilizando como modelo a Sphingobium yanoikuyae

En 2017 desafortunadamente fallece el Dr. Alberto Mendoza Herrera y en 2018 el Dr. Virgilio Bocanegra García se incorpora como responsable del laboratorio, incluyendo una línea de investigación adicional enfocada a la detección y caracterización funcional de microrganismos con potencial actividad patogénica a partir del medio ambiente. Con todo esto, quedan integradas cuatro líneas de investigación y mediante la integración de estas, se tiene la visión de caracterizar integralmente las poblaciones microbianas de nuestra región y de otras zonas en colaboración con diferentes investigadores. Esto con la finalidad de conocer mejor su ecología y derivar de ahí posibles aplicaciones en el área agrícola, degradación de xenobióticos y detección y evaluación de riesgo patogénico. 

Todo lo anterior aunado a análisis genómicos funcionales y estructurales nos permitirá conocer a detalle los fenómenos moleculares que condicionan un microorganismo a una función u otra. Por esta razón el nombre del laboratorio se adecuó una vez más a “Laboratorio Interacción Ambiente-Microorganismo” como una forma de mantener la visión inicial del fundador, pero con una ligera modificación que permita una integración global de las líneas de investigación que actualmente se trabajan.

​​Líneas de Generación y/o Aplicación de Conocimiento

1. Biodiversidad y análisis de poblaciones microbianas implicadas en interacciones con vegetales 

a. Biología funcional de Azospirillum sp 

b. Caracterización de poblaciones microbianas asociadas a rizosfera 

c. Caracterización funcional de poblaciones microbianas en suelos 

d. Efecto de cultivos transgénicos sobre poblaciones microbianas nativas 


 

2. Caracterización de microorganismos con potencial metabolismo de xenobióticos 

a. Biología funcional de Sphingobium yanoikuyae 

b. Biología funcional de Microbacterium sp 

c. Aislamiento y caracterización de microorganismos nativos con potencial aplicación biotecnológica en degradación de xenobióticos 

d. Estudio de efecto de consorcios de microorganismos con actividad degradativa de xenobióticos 


 

3. Ecología y epidemiologia de microorganismos con capacidad patogénica 

a. Inocuidad microbiológica de alimentos 

b. Inocuidad microbiológica ambiental 

c. Epidemiología molecular de microorganismos patógenos distribuidos en el medio ambiente 

d. Actividad antimicrobiana de productos naturales 

e. Polimorfismos relacionados a resistencia o susceptibilidad a infecciones 


 

4. Genómica microbiana funcional 

a. Diversidad genética de microorganismos con capacidad patogénica 

b. Epidemiología molecular de elementos genéticos móviles en microorganismos del medio ambiente 

c. Genómica funcional de microorganismos con potencial biotecnológico

​​Tesis en Proceso

Doctorado 

"Efecto en la diversidad bacteriana asociada a la rizosfera de un algodón transgénico respecto a uno convencional" 

"Análisis fisiológico y genómico de una bacteria con capacidad de degradar hidrocarburos: Sphingobium yanoikuyae

“Detección, prevalencia y análisis molecular de la diversidad bacteriana con potencial de riesgo sanitario en aguas superficiales del rio bravo en Tamaulipas” 

“Análisis del resistoma y mobiloma en cepas de E. coli resistentes a tetraciclinas aisladas en el Noreste de Tamaulipas” 

“Caracterización del perfil inmuno-microbiológico de infecciones en heridas de pie diabético”

 “Caracterización molecular y de resistencia a antimicrobianos de Escherichia coli y Enterococcus spp. aisladas en el proceso de sacrificio de bovinos en un rastro TIF” 

Maestría 

"Análisis e identificación de genes relacionados con el estrés bacteriano en Azospirillum brasilense CBG 497" 

"Caracterización de una cepa de Microbacterium petrolarium aislada de suelos contaminados con hidrocarburos en la cuenca de Burgos" 

“Detección molecular de amibas de vida libre en aguas superficiales de la ciudad de Reynosa, Tamaulipas” 

“Detección molecular directa de bacterias Gram-positivas y anaerobias de alto riesgo de infecciones en pie diabético” 

“Detección de especies del género Mycobacterium en aguas superficiales del Noreste de Tamaulipas”

Transferencia de la tecnología

Producción de Bioestimulante basado en la bacteria Azospirillum brasilense a la empresa Open Heavens. S. de R.L. de CV. Febrero de 2010. Producto biológico para la estimulación del crecimiento en gramíneas a base de Azospirillum brasilense. BioGea S.A., de CV. 2014 

Solicitud de patente

Cepas bacterianas con actividad bio-estimulante para plantas. MX/a/2017/015637

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Personal del Laboratorio

Alberto Mendoza Herrera.   
Virgilio Bocanegra García. Profesor Titular,             Ext. 87741, Correo: vbocanegra@ipn.mx
Silvia Susana Fernández Dávila, Técnico Investigador, Ext. 87741 Correo: sfernandezd@ipn.mx

Eyra Liliana Ortiz Pérez, Técnico Investigador,         Ext. 87741, Correo: eortizp@ipn.mx

María Antonia Cruz Hernández. Profesor Asociado, Ext. 87717, Correo: macruzh@ipn.mx


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